药植所围绕药用植物的全产业链开展对外技术合作，涉及资源、栽培、生物、药理、化学五大研究领域，设有资源、亲缘学、鉴定、栽培、生物技术、生物信息、药理、天然药化、制剂、分析检测、科技开发等多个研究中心。

        药植所对外开展的横向合作包括：技术服务、技术开发、技术许可、技术转让等。其中，技术服务类合作方向有：细胞组培、工厂化育苗、药材质量等级评价、遗传多样性分析、资源评估和鉴定、菌种改良、基原种源鉴定、基原物种DNA条形码分子鉴定、栽培选种育种、病虫害防治、土壤改良、GAP建设服务、作用靶标研究、作用机制研究、量效关系研究、药效评价、晶体结构测定、NMR/MS/HRMS/UV/IR/XRD等分析测试、农残及重金属检测、有效成分检测、分离鉴定及定性定量分析等。技术开发类合作内容有：原料药材开发、新食品及功能食品开发、保健品开发、消杀品及化妆品开发、新药开发及工艺改进、基地生产等。

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